Почему ДНК — это кислота?

Мы привыкли слышать про ДНК в контексте генов, наследственности, спиралей и повторяющихся цепочек. Но многие удивляются, узнав, что по своей химической природе это самая настоящая кислота. Разберемся, почему.

© Arena/TheSpaceway

Название говорит само за себя

Аббревиатура ДНК расшифровывается как «дезоксирибонуклеиновая кислота». Слово «кислота» здесь не для красоты, а строго по химической сути молекулы.

Кстати, открыл ее именно как кислоту швейцарский биохимик Фридрих Мишер еще в 1869 году. Изучая клеточные ядра лейкоцитов, он выделил неизвестное ранее вещество и назвал его «нуклеин» (от лат. nucleus — ядро). Позже, когда стало ясно, что вещество обладает кислотными свойствами, термин трансформировался в «нуклеиновую кислоту».

Что делает вещество кислотой?

Согласно протолитической теории Брёнстеда — Лоури, кислота — это химическое вещество, которое может отдавать ион водорода (H⁺), то есть выступать донором протона.

Теперь смотрим на структуру ДНК. Ее «хребет» — это чередующиеся молекулы сахара (дезоксирибозы) и фосфатных групп, соединенных в длинную цепь. Именно фосфатные группы и есть химический источник кислотности.

Структура ДНК с четырьмя азотистыми основаниями: аденин (A), гуанин (G), цитозин (C) и тимин (T). Показаны большая и малая бороздки / © Zephyris/TheSpaceway

Каждая фосфатная группа способна легко отщеплять ион водорода. В физиологических условиях, то есть при обычном pH внутри клетки, эти группы практически всегда находятся в отданном состоянии: они уже «потеряли» водород и приобрели отрицательный заряд.

Отрицательный заряд ДНК — ключевое свойство, определяющее ее поведение:

Связь с белками

Внутри клеточного ядра ДНК плотно упакована вокруг белков-гистонов, которые заряжены положительно. Именно притяжение противоположных зарядов — отрицательной ДНК и положительных гистонов — позволяет метровым нитям ДНК компактно «наматываться» и умещаться в микроскопическом ядре клетки.

Электрофорез в лабораториях

Если поместить ДНК в электрическое поле, она будет двигаться к положительному электроду — именно из-за отрицательного заряда фосфатных групп. На этом принципе основан метод гель-электрофореза: ДНК помещают в гель и пропускают электрический ток. Отрицательно заряженные молекулы начинают двигаться к положительному электроду, причем короткие фрагменты перемещаются быстрее длинных. В результате они разделяются по размеру.

Этот метод стал базовым в генетике, судебной экспертизе и медицинской диагностике.

Экстракция ДНК в домашних условиях

На отрицательном заряде ДНК основан и известный эксперимент по выделению ДНК, который можно провести даже дома. Для этого берут, например, клубнику или банан: сначала плод измельчают, добавляют моющее средство, чтобы разрушить клеточные мембраны, затем соль, которая нейтрализует отрицательный заряд фосфатных групп. После фильтрации добавляют холодный спирт — в нем ДНК не растворяется и выпадает в осадок в виде видимых белых нитей.

ДНК, выделенная из клубники в рамках учебного эксперимента. Белые нити в пробирке — это отделившиеся молекулы ДНК / © Joo Nath

А как же азотистые основания?

Тут есть небольшой нюанс. В структуре ДНК помимо сахарофосфатного скелета есть еще азотистые основания — аденин, тимин, гуанин, цитозин. Это те самые буквы генетического кода. По своей химической природе они скорее слабо-основные или нейтральные соединения, а не кислотные.

Но кислотность всей молекулы определяется именно «скелетом» — непрерывной цепью фосфатных групп, которые тянутся вдоль всей длины ДНК. Поэтому суммарно, как единое целое, молекула ведет себя как полианион — длинная цепь с множеством отрицательных зарядов, то есть как полностью диссоциировавшая (отдавшая водород) кислота.

Читайте также: В образцах астероида Рюгу нашли все пять оснований ДНК и РНК.

TG_TheSpaceway

Добавить комментарий

Ваш адрес email не будет опубликован. Обязательные поля помечены *